De lo que conocía, si, el SRTM es más preciso respecto a altitud, pero con una menor resolución, corregir el ASTER GDEM sería muy difícil pues se deberían modificar los valores de los cuáles no sabes nada respecto a la distribución del error, quizá podrías validar los dos modelos con algunos datos que tu tengas de la zona de estudio para ver cual de los dos se ajusta mejor, estimando algún estadístico tipo RMSE y luego en función de tus necesidades podrías emplear uno u otro.