Muchas gracias David.
En el video encontré varias herramientas útiles. Align to Shape fue la herramienta que hizo la tarea mas automatizada, aunque no me gustó mucho el resultado, ya que me superpuso muchos polígonos. Terminé utilizando la herramienta de Auto Complete Polygon, aunque la tarea es mucho mas trabajosa debido q que tengo muchísimos huecos para rellenar.