Hola, graba un Shp de copia para unir con el resto, por lo general se elige uno con la mayor cantidad de poligonos, de esta forma hay que copiar menos. Ese nuevo Shp va a ser en el que pegues el resto de los poigonos que quieras sumar. Puedes hacerlo editando el shp a copiar, seleccionas los poligonos que deseas agregar y luego le indicas copy, desde ahi te vas y editas el nuevo que grabaste y de indicas paste, respaldas grabando y repites los pasos como cuantos shp o poligonos quieras agregar. Esta forma tiene la ventaja que puedes juntar partes de un shp con otro sin necesidad que una todas sus figuras. Muy importante que todos los Shp que vas a fusionar usen la misma proyeccion porque de lo contrario quedan en la proyeccion del Shp en que los estas pgando. Suerte