Por lo general los DGN de IMG se encuentran georreferenciados, pero bueno, entonces desde ArcMap carga como cualquier capa el archivo DGN (no olvides exportar como 3D desde MicroStation, para conservar los valores de las curvas de nivel), identifica puntos de los cuales conoces las coordenadas (supongo que sí es una carta, un punto superior derecho y un inferior izquierdo es suficiente), ahora añade las coordenadas con la herramienta Add control points de la barra Georeferencing.