Hola, yo lo haría con un shp de las áreas de interés a clasificar, extraes la cantidad de pozos comprendidos en cada una y solo lo relacionas con el área de las mismas para lograr el indicador que necesitas como tus ejemplos. Otra cosa que puedes hacer es una interpolación de los pozos, método kriging, hasta podrías usar los caudales si los tienes y te quedarías con un raster de densidad de extracción de agua por pixel los cuales puedas extraer y formar otros indicadores a tu gusto.
Espero sirva
Sds.
JL