Hola Luis, muchas gracias por tu respuesta. He puesto en practica tus consejos pero no acabé de conseguir el objetivo deseado, así que tiré por la calle del medio y lo que hice fué abrir las capas en GvSig, hacer la transformación y volver a Qgis. Es muy rápido y sencillo.
Muchas gracias de nuevo por tus consejos.