Hasta donde llega mi conocimiento en QGIS no es posible editar varias capas simultáneamente. La edición en QGIS se realiza por capa, es decir, se selecciona una capa para entrar en el modo de edición, y luego las operaciones de edición (como mover, cortar, agregar o eliminar funciones) se aplican solo a esa capa.