Yo he trabajado en dos zonas Norte y Sur, en cuyo caso para evitarme cargas de trabajo muy grandes usé una sola zona para todo el trabajo, poniendo en evidencia claramente las razones de mi elección, en mi caso, admití coordenadas en el eje Y superiores a 10 km.
Quizá en tu caso debas especificar tu problema en la documentación de tu trabajo, y reproyectar una parte de la información al otro sistema, podrías usar el criterio de reproyectar la que menor dificultad implique.