Saludos, supongo que cuentas con un modelo digital detallado de tu área de estudio
En ese caso, te recomiendo utilizar programas específicos con Hec Ras o el IRIC
Con GRASS GIS, pero en este caso no es recomendable que trabajes a través de QGIS sino en GRASS puedes realizar una buena aproximación, con r.basin, r.patch.smooth, r.sim.water