Muchas gracias por la respuesta,
1) estoy utilizando una i3 con 4gb de memoria
2) la escala que trabajare es de 1:100000
Evidentemente, trate de eliminar los micro polígonos, sin embargo cuando hago la misma operación cae el error de topología (cuando se ejecuta ELIMINATE, lee todos los polígonos y al encontrar un o más errores topológicos no puede procesar el comando), ojala se pueda solucionar eso, muchas gracias por la respuesta.