Creo que lo más sencillo es que en tu capa de polígonos, dentro de la tabla de atributos creas un nuevo campo y los numeras (o inclusive el área te puede servir de identificador). Luego los conviertes a líneas, luego a puntos conservando su vértices, calculas las coordenadas XY y copias la tabla. El campo de numeración o área te va a permitir identificarlos.